霉菌性陰道炎的致病菌主要為假絲酵母菌，這種條件致病菌在正常情況下多存在于女性陰道內(nèi)而不引起疾病。當機體免疫力下降，如長期使用廣譜抗生素、大量應用免疫抑制劑、接受雌激素治療、妊娠、糖尿病等情況下，假絲酵母菌會大量繁殖并侵襲組織，引發(fā)炎癥反應。80%-90%的霉菌性陰道炎由白假絲酵母菌引起，其余還包括光滑假絲酵母菌、近平滑假絲酵母菌、熱帶假絲酵母菌等。這些假絲酵母菌可以在人的口腔、腸道寄生，亦可通過性交直接接觸傳染以及間接傳染。