慢性細菌性痢疾的治療需要綜合多種手段。病原治療是關鍵，需通過藥物敏感試驗挑選有效的抗菌藥物，進行7-10天為一療程的治療，并根據(jù)需要可能進行多個療程。灌腸療法對于腸黏膜病變的患者有效，每晚進行一次，療程通常為10-14天。此外，疫苗治療能增強人體免疫功能，提高抵抗力。同時，微生態(tài)制劑如乳酸桿菌或雙歧桿菌等有助于調節(jié)腸道菌群平衡。改善全身狀態(tài)、糾正營養(yǎng)不良和貧血，以及心理治療等也是治療的重要方面。